Технологии
CORE TECH
Принцип нанопорового секвенирования
Нанопоры обычно представляют собой поровые структуры диаметром 1-10 нм. Нанопоры могут быть встроены в фосфолипидные мембраны путем самосборки, образуя трансмембранные каналы.
При подаче напряжения на нанопору отрицательно заряженные молекулы нуклеиновых кислот в образце под действием электрофореза проходят через нанопору, генерируя специфические токовые сигналы.
Анализируя временные характеристики этих сигналов, можно определить последовательность нуклеотидов, осуществляя секвенирование ДНК.
Преимущества
Длинные прочтения
Длина прочтения не ограничена и зависит от длины фрагмента образца. Это позволяет отображать полные последовательности генов, облегчая обнаружение структурных вариаций.
Низкая стоимость
Отделение от чипа сбора сигналов значительно снижает стоимость одноразовых расходных материалов.
В реальном времени
Результаты секвенирования выводятся в реальном времени без долгого ожидания.
Портативность
Значительно меньше устройств NGS, что позволяет проводить секвенирование где угодно и когда угодно.
Скорость
Простая подготовка библиотек и возможность остановить секвенирование в любой момент значительно сокращают время выполнения.
Прямое детектирование
Не требуется ПЦР-амплификация; прямое секвенирование эпигенетических модификаций и РНК.
Применение
Онкология
Сопроводительная диагностика опухолей: определение рецепторных сайтов для таргетной терапии.
Генетика
Диагностика генетических заболеваний: обнаружение мутаций в крупных фрагментах генома.
Экология
Мониторинг окружающей среды: ампликонное секвенирование и метагеномика.
Патогены
Обнаружение патогенов: в 4-6 раз быстрее традиционных методов (бактерии, вирусы, грибки).
Криминалистика
Судебно-медицинская идентификация: получение неопровержимых доказательств.
Безопасность
Агропродовольственная безопасность: обнаружение тяжелых металлов, биотоксинов и добавок.